Embedded Files
A collaborative service that guides plant researchers from experimental design to integrated, publishable biological insight.
A collaborative service that guides plant researchers from experimental design to integrated, publishable biological insight.
與植物研究團隊協作，從實驗設計一路到整合分析，協助萃取出可驗證、可發表的生物學洞見。
與植物研究團隊協作，從實驗設計一路到整合分析，協助萃取出可驗證、可發表的生物學洞見。
讓資料分析不再是研究路上的絆腳石
讓資料分析不再是研究路上的絆腳石
Hi，我們是農生中心的生資分析團隊
你是否曾經：
看著 RNA-seq 資料不知從何下手？
想做個漂亮的 heatmap 卻卡在參數設定？
需要跑分析但實驗室沒有適合的人力？
或只是單純覺得「我明明是做生物的，為什麼要學這麼多程式」？ 沒關係，這就是我們存在的原因。
我們能幫什麼忙？
我們能幫什麼忙？
各種 NGS 資料分析
各種 NGS 資料分析
RNA-seq、變異體分析、比較基因體... 標準流程我們都熟。
非模式生物？沒問題，我們處理過各種奇怪的物種（真的很奇怪的都有）。
把資料變成好看的圖
把資料變成好看的圖
不只是「能看」，而是「好看」+ 「資訊清楚」的發表級圖表。
當然，如果你只需要初步探索的簡單圖，我們也很樂意幫忙。
影像分析也 OK
影像分析也 OK
細胞計數？葉片面積？根系追蹤？
影像分析其實是我們的隱藏技能。
純聊天也可以
純聊天也可以
卡關了想討論分析策略？
不確定樣本數夠不夠？
只是想確認「這樣做對不對」？
來聊聊吧，有時候講一講就通了。
合作可以很彈性
合作可以很彈性
急件模式：下週要meeting？我們試試看能幫上什麼
自己來但偶爾求救：大部分自己跑，卡關時找我們 debug
完全外包：把資料丟給我們，定期回報進度就好
共同開發：一起設計全新的分析流程 (這個最好玩)
你決定參與多少，我們配合。
為什麼現在不收費？
為什麼現在不收費？
坦白說，我們正在了解中心的需求有多大，所以目前是試營運階段。
你的案子會幫助我們了解：
大家最需要哪些分析？
什麼樣的合作模式最順暢？
未來該如何規劃這個 core 的發展？
所以現在找我們，算是互相幫忙。你得到分析結果，我們累積經驗值。
不過，有些話要先說
不過，有些話要先說
我們會盡力，但沒辦法保證所有分析都能做（技術限制是存在的）
論文寫作我們能幫 Methods，但 Introduction 和 Discussion 還是要靠你
如果你的資料品質真的有問題，我們會誠實告訴你（用友善的方式）
想聊聊嗎？
想聊聊嗎？
最簡單的開始：
寄個 email 說「我有 XXX 資料想分析」
或是直接丟個你卡住的錯誤訊息
甚至只是說「我需要畫個圖但不知道怎麼做」
Email: pxzheng at as.edu.tw
回覆通常很快，因為我們也在電腦前面寫程式（或是 debug...）。
🖥️生物資訊不可怕，只是需要對的夥伴。
What we do / 我們在做什麼
What we do / 我們在做什麼
A collaborative service for turning complex plant data into clear, testable insight
A collaborative service for turning complex plant data into clear, testable insight
We work with plant scientists to design robust experiments, interpret multi-layered sequencing data, and connect results back to concrete biological mechanisms.
From RNA-seq to genome variation, we help you build an integrated narrative that is ready to be challenged, validated, and published.
專為植物研究打造的實驗設計，與資料整合協作服務
專為植物研究打造的實驗設計，與資料整合協作服務
與植物科學研究者並肩合作，從實驗設計出發，協助解讀多層次定序資料，將結果拉回具體的生物學機制。
從基因表現到各類基因體差異，我們協助你把零散的結果整理成有脈絡、可驗證、可發表的研究故事。
What we do / 我們在做什麼
What we do / 我們在做什麼
Design, data, and biological reasoning on the same page
Design, data, and biological reasoning on the same page
Pre-experiment consulting and design review
Integrated analysis of genome / RNA-seq / multi-omics data
Shaping research narratives from data to mechanism
Technical guidance for validation experiments and manuscript planning
讓實驗、資料與生物學邏輯在同一頁上對齊
讓實驗、資料與生物學邏輯在同一頁上對齊
實驗前諮詢與設計檢視
genome / RNA-seq / multi-omics的整合解讀
從結果到機制假說的研究敘事設計
後續驗證實驗與投稿策略的技術型意見
Who we work with / 適合對象
Who we work with / 適合對象
Principal investigators and laboratory heads
Research groups with substantial sequencing data that have not yet been fully integrated
Teams planning multi-omics projects or grant proposals
PI、實驗室負責人
有大量定序資料但尚未整合的研究團隊
正在規劃 multi-omics 專題或計畫案者
How we work / 協作方式
How we work / 協作方式
Initial conversation to clarify the research questions
Drafting an experimental and analytical roadmap, including potential data integration directions
Participating as needed in downstream analysis review and refinement of the scientific narrative
初步會談 → 釐清研究問題
草擬實驗與分析藍圖（含可能的資料整合方向）
依實際需求參與後續分析檢視與敘事打磨
Service / 服務
Service / 服務
Collaborative, project-focused discussions that align experimental design, data collection, and biological questions, so downstream analyses carry real explanatory and decision-making value.
以專題為核心的協作式討論，協助對齊實驗設計、資料取得與生物學問題，讓後續分析具備實質的解釋力與決策價值。
Careful, hypothesis-aware analysis of genome and sequencing data, with emphasis on cross-layer integration and on turning gene lists into coherent, testable biological insight.
在明確研究假說的前提下，謹慎處理基因體與各類定序資料，重點放在跨層級整合，將一串基因名單轉化為可驗證、可溝通的生物學洞見。
Targeted, hands-on sessions for plant biologists that demystify modern sequencing analysis and teach practical strategies for experimental design, data interpretation, and working effectively with bioinformaticians.
為植物生物學研究者設計的實作型課程，說清楚現代定序分析在做什麼，並分享實務上的實驗設計、結果解讀，以及與生物資訊團隊有效合作的策略。
Page updated
Report abuse